各位新老學(xué)員：
大家好！
美德醫(yī)療在大家的支持和鼓勵(lì)下，不斷推出新的培訓(xùn)課程，多年來(lái)連續(xù)舉辦各類fMRI培訓(xùn)班，至今已經(jīng)第九屆了，為各學(xué)科人才在科研工作中提供學(xué)習(xí)和交流等資源共享平臺(tái)，得到了業(yè)內(nèi)人士的高度肯定，fMRI的培訓(xùn)班已經(jīng)日趨常規(guī)和系統(tǒng)化，每年都會(huì)舉辦至少兩期。其中我們很多學(xué)員都學(xué)有所成，取得了驕人的成績(jī)，我們也倍感欣慰。經(jīng)過(guò)和學(xué)員以及幾位授課專家總結(jié)經(jīng)驗(yàn)，以后的培訓(xùn)將以專題為目標(biāo)，深入細(xì)致講解各種技術(shù)的原理和應(yīng)用。本次培訓(xùn)班將以深入學(xué)習(xí)靜息態(tài)fMRI技術(shù)和多模態(tài)融合方法，聘請(qǐng)研究領(lǐng)域最優(yōu)秀的講師團(tuán)隊(duì)，培訓(xùn)班將保留往屆非常受歡迎的數(shù)據(jù)處理解析，科研思路講解，學(xué)員的互動(dòng)討論環(huán)節(jié)，使得課程更加實(shí)用，也為學(xué)員中科研人才和臨床醫(yī)生合作搭建橋梁，希望我們?cè)诮鹎飼r(shí)節(jié)一起收獲新的知識(shí)。
現(xiàn)就報(bào)名有關(guān)事宜說(shuō)明如下：
1. 培訓(xùn)班報(bào)到時(shí)間為11月21日下午6：00前，晚上開(kāi)始上課，精彩不容錯(cuò)過(guò)。
2. 為便于會(huì)務(wù)安排，報(bào)名時(shí)請(qǐng)按照回執(zhí)表認(rèn)真填寫(xiě)并email給會(huì)務(wù)組。由于報(bào)名名額有限，請(qǐng)學(xué)員盡早報(bào)名，盡量用電匯的方式提前轉(zhuǎn)帳確認(rèn)，現(xiàn)場(chǎng)不能刷卡繳費(fèi)。
3. 希望參加發(fā)言討論的學(xué)員請(qǐng)盡快報(bào)名，將研究摘要以poster形式發(fā)給會(huì)務(wù)組。所有墻報(bào)經(jīng)專家評(píng)選出口頭報(bào)告5-10個(gè)，口頭報(bào)告之后，同時(shí)參加poster交流。具體內(nèi)容可以是已經(jīng)發(fā)表的文章、未發(fā)表的初步研究結(jié)果，甚至僅僅是研究設(shè)計(jì)。墻報(bào)寬度90厘米，高度120厘米。墻報(bào)交流過(guò)程中，所有授課專家全程參與，以保證專家與學(xué)員、學(xué)員與學(xué)員的充分交流。
附：數(shù)據(jù)處理軟件操作培訓(xùn)班調(diào)研表：
美德醫(yī)療將聯(lián)手多個(gè)研究單位，并依托香港中文大學(xué)深圳研究院醫(yī)學(xué)影像研究培訓(xùn)中心，建立數(shù)據(jù)處理培訓(xùn)中心，配置超高速處理工作站，用于多種fMRI技術(shù)所需要的軟件上機(jī)操作培訓(xùn)。我們將不定期根據(jù)報(bào)名和需求情況開(kāi)辦實(shí)操培訓(xùn)，聘請(qǐng)專業(yè)的講師和博士研究生團(tuán)隊(duì)按步驟演示軟件的運(yùn)行，為了了解大家對(duì)各軟件學(xué)習(xí)的需求，我們特列出了可能需要學(xué)習(xí)的各種軟件，希望先做一個(gè)摸底調(diào)查，根據(jù)大家的需求權(quán)重高低開(kāi)設(shè)課程。請(qǐng)各位學(xué)員認(rèn)真填寫(xiě)并email給會(huì)務(wù)組。
感謝大家對(duì)美德醫(yī)療的支持，我們將一如既往地堅(jiān)持培訓(xùn)工作，為大家?guī)?lái)持續(xù)學(xué)習(xí)的機(jī)會(huì)和專家交流的良好平臺(tái)。
順祝大家中秋國(guó)慶節(jié)日快樂(lè)，合家團(tuán)圓！
美德醫(yī)療
2013年9月
第九屆功能磁共振影像(fMRI)培訓(xùn)班
--- 靜息態(tài)fMRI技術(shù)及應(yīng)用專題
中國(guó)·北京 2013.11.21 – 11.24
主辦單位： 北京中科美德醫(yī)療信息科技有限公司
深圳市美德醫(yī)療電子技術(shù)有限公司
講師單位： 北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
杭州師范大學(xué)認(rèn)知與腦疾病研究中心
中國(guó)科學(xué)院心理研究所
臺(tái)灣長(zhǎng)庚大學(xué)醫(yī)學(xué)院
耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院
1. 研討會(huì)簡(jiǎn)介
功能磁共振影像（fMRI）近年來(lái)的發(fā)展日新月異，已成為研究認(rèn)知和臨床腦疾病的重要技術(shù)。靜息態(tài)功能磁共振成像（Resting-State fMRI）作為研究靜息下人腦自發(fā)腦功能活動(dòng)的重要手段，近十年來(lái)得到了快速發(fā)展，特別是與之相關(guān)的數(shù)據(jù)分析方法如研究腦區(qū)局部特征的方法（ReHo, ALFF等）和研究腦區(qū)之間關(guān)系的網(wǎng)絡(luò)分析(Brain network Analysis)等。利用靜息態(tài)fMRI技術(shù)，研究人員能夠獲取腦局部活動(dòng)、功能連接、腦網(wǎng)絡(luò)屬性等多維度信息，為全面深入了解認(rèn)知的神經(jīng)機(jī)制以及神經(jīng)精神疾病如精神分裂癥、老年癡呆癥、兒童注意缺陷多動(dòng)障礙、癲癇、中風(fēng)、腦外傷等臨床問(wèn)題的神經(jīng)生理病理學(xué)機(jī)制提供了重要幫助。
本次培訓(xùn)班的宗旨是讓學(xué)員們能夠深入了解靜息態(tài)fMRI技術(shù)在國(guó)際、國(guó)內(nèi)的最新進(jìn)展，掌握靜息fMRI的基本原理，了解相關(guān)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、影像采集、數(shù)據(jù)處理、結(jié)果解釋等方面的知識(shí), 為做出高水平的研究工作提供幫助。本培訓(xùn)班將結(jié)合實(shí)例，重點(diǎn)介紹靜息態(tài)fMRI在認(rèn)知研究和臨床實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)所需要的基本要素以及數(shù)據(jù)處理相關(guān)的統(tǒng)計(jì)方法。此外，培訓(xùn)班還將講授靜息態(tài)fMRI論文寫(xiě)作中的技巧和注意事項(xiàng)。
本次培訓(xùn)班主要包含三方面內(nèi)容：
-
由諸多著名專家學(xué)者介紹靜息fMRI新技術(shù)的基本原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析的最新進(jìn)展。專家學(xué)者結(jié)合自身研究方向, 講解靜息fMRI在認(rèn)知和臨床腦疾病研究中的應(yīng)用。
-
延續(xù)以往培訓(xùn)中備受歡迎的“Panel Discussion”環(huán)節(jié)，全體講師齊聚講臺(tái)，針對(duì)靜息態(tài)fMRI領(lǐng)域中的熱點(diǎn)話題以及學(xué)員現(xiàn)場(chǎng)的提問(wèn)，闡述各自不同觀點(diǎn)和經(jīng)驗(yàn)，與大家分享科研心得。
-
由專家學(xué)者講解靜息態(tài)fMRI科學(xué)論文的寫(xiě)作。專家學(xué)者將會(huì)用親身經(jīng)驗(yàn)解悟靜息態(tài)fMRI相關(guān)論文寫(xiě)作的要點(diǎn)和難點(diǎn), 并且結(jié)合自己已發(fā)表的論文作為范例，講解從起草到發(fā)表的具體過(guò)程。
-
由學(xué)員以墻報(bào)或口頭的形式報(bào)告自己的研究方向(自愿參與)，并由專家學(xué)者做點(diǎn)評(píng)。對(duì)該活動(dòng)感興趣的學(xué)員，請(qǐng)?zhí)崆?5天將摘要以poster形式發(fā)給會(huì)務(wù)組。所有墻報(bào)經(jīng)專家評(píng)選出口頭報(bào)告2-3個(gè)，口頭報(bào)告之后，同時(shí)參加poster交流。具體內(nèi)容可以是已經(jīng)發(fā)表的文章、未發(fā)表的初步研究結(jié)果，甚至僅僅是研究設(shè)計(jì)。墻報(bào)寬度90厘米，高度120厘米。墻報(bào)交流過(guò)程中，所有授課專家全程參與，以保證充分的專家與學(xué)員、學(xué)員與學(xué)員的交流。此次培訓(xùn)班側(cè)重臨床應(yīng)用，面向所有與腦疾病相關(guān)的臨床醫(yī)生以及認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)研究人員，大家一定會(huì)獲益匪淺。
在金秋時(shí)節(jié)，在首都北京，我們熱忱期待您的光臨！
2. 授課專家
臧玉峰，1984年于河北醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)系獲醫(yī)學(xué)學(xué)士學(xué)位、1991年于天津醫(yī)學(xué)院獲神經(jīng)外科學(xué)碩士學(xué)位、2002年于北京大學(xué)獲精神病學(xué)博士學(xué)位。現(xiàn)任杭州師范大學(xué)認(rèn)知與腦疾病研究中心教授。曾從事神經(jīng)外科工作十余年。近十幾年來(lái)一直從事靜息態(tài)功能磁共振計(jì)算方法及其在腦疾病的應(yīng)用研究。合作發(fā)表英文論文約90多篇，被SCI引用共3000多次（其中，2012年全年被引用約1000次）。與同事一道，提出了“局部一致性”（Zang et al., 2004, NeuroImage）和“低頻振幅”（Zang et al., 2007, Brain Dev）方法。帶領(lǐng)研究組開(kāi)發(fā)了針對(duì)靜息態(tài)fMRI的數(shù)據(jù)處理軟件包REST和“流水線”式軟件包DPARSF。國(guó)際上引用這些軟件的英語(yǔ)論文約200篇。目前帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊(duì)包括張寒研究員、廖偉研究員、劉東強(qiáng)副研究員、廖旭紅副研究員等人，并與多家單位合作，開(kāi)展靜息態(tài)fMRI方法學(xué)及其在腦疾病的應(yīng)用研究，如神經(jīng)反饋、癲癇、術(shù)前術(shù)中功能定位、DBS和TMS靶點(diǎn)定位、注意缺陷多動(dòng)障礙、自發(fā)記憶鞏固與記憶障礙等。
賀永，博士，國(guó)家杰出青年基金獲得者，北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員（PI），兼任IDG/麥戈文腦科學(xué)研究所研究員（PI），博士生導(dǎo)師。目前兼任山東大學(xué)、首都醫(yī)科大學(xué)等國(guó)內(nèi)外10余所高校、醫(yī)院、省部級(jí)實(shí)驗(yàn)室兼職教授、專家、學(xué)術(shù)委員等。2005年在中科院自動(dòng)化研究所獲博士學(xué)位。2005年至2007年在加拿大麥基爾（McGill）大學(xué)蒙特利爾神經(jīng)學(xué)研究所從事博士后研究。2008年回國(guó)在北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作，擔(dān)任“計(jì)算神經(jīng)影像與人腦連接組”團(tuán)隊(duì)學(xué)術(shù)帶頭人。先后主持國(guó)家杰出青年基金、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、北京市自然科學(xué)基金等多項(xiàng)國(guó)家和省部級(jí)課題。現(xiàn)任國(guó)際期刊《Frontiers in Human Neuroscience》、《PLoS ONE》和《Brain Connectivity》編委，美國(guó)阿爾茨海默病協(xié)會(huì)、荷蘭阿爾茨海默病協(xié)會(huì)、法國(guó)國(guó)家研究署、英國(guó)哈德溫博士人道研究基金會(huì)、國(guó)家自然科學(xué)基金委等10余個(gè)國(guó)內(nèi)外機(jī)構(gòu)的基金評(píng)審專家，以及Am J Psychiatry, Ann Neurol, Brain, J Neurosci等30余個(gè)國(guó)際期刊論文評(píng)審人。在PNAS, Brain, Biol Psychiatry, J Neurosci等本領(lǐng)域主流期刊共發(fā)表SCI論文105篇，SCI總引用3400余次，H指數(shù)28。2009年和2011年獲Scopus青年科學(xué)家獎(jiǎng)（生命科學(xué)領(lǐng)域）和國(guó)際心理科學(xué)聯(lián)合會(huì)APS Observer新星獎(jiǎng)。帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)腦網(wǎng)絡(luò)分析和可視化軟件包Gretna和BrainNet Viewer。主要研究領(lǐng)域?yàn)橛?jì)算神經(jīng)影像與人腦連接組學(xué)。詳細(xì)介紹，請(qǐng)參考
http://psychbrain.bnu.edu.cn/teachcms/heyong.htm。
畢彥超，北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、IDG/McGovern Institute for Brain Research 研究員、團(tuán)隊(duì)帶頭人(Principal Investigator)。于2006年獲哈佛大學(xué)心理學(xué)系腦、認(rèn)知、行為專業(yè)博士學(xué)位。作為首席科學(xué)家主持973計(jì)劃青年項(xiàng)目，是國(guó)家自然科學(xué)基金委優(yōu)秀青年基金獲得者，擔(dān)任北京神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)理事。主要圍繞語(yǔ)言和語(yǔ)義記憶的認(rèn)知神經(jīng)基礎(chǔ)進(jìn)行研究，作為通訊作者在Brain, Journal of Neuroscience、Cortex、NeuroImage、Brain and Language等國(guó)際心理學(xué)和神經(jīng)心理學(xué)雜志發(fā)表多篇論文。曾獲Sackler Scholars Programme in Psychobiology獎(jiǎng)項(xiàng)和國(guó)際心理科學(xué)聯(lián)合會(huì)新星獎(jiǎng)。
劉鶴齡，教授，博士，臺(tái)灣長(zhǎng)庚大學(xué)醫(yī)學(xué)院，醫(yī)學(xué)影像暨放射科學(xué)系教授，臺(tái)灣長(zhǎng)庚醫(yī)院放射診療部特聘顧問(wèn)。畢業(yè)于臺(tái)灣清華大學(xué)物理系，2000年于美國(guó)德州大學(xué)獲醫(yī)學(xué)物理博士，從事血液灌注之計(jì)算方法與fMRI的技術(shù)研究。完成博士學(xué)位后返回臺(tái)灣工作，與臨床放射科、神經(jīng)內(nèi)外科、復(fù)建科、精神科、眼科及中醫(yī)多位醫(yī)師專家合作，進(jìn)行磁共振臨床研究課題，并持續(xù)與大陸及香港多位杰出心理學(xué)家合作，在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域有新的探索。目前共發(fā)表有70余篇SCI論文，并為NeuroImage, Human Brain Mapping, MRM, JMRI等知名期刊審稿。2004年獲RSNA/AAPM資助至德州安德森癌癥中心完成一年臨床影像物理Residency訓(xùn)練，并通過(guò)考試獲美國(guó)放射專科（ABR）認(rèn)可診斷醫(yī)學(xué)物理師資格。2010年至加州大學(xué)圣地亞哥分校Center for Functional MRI半年，研習(xí)最新的ASL技術(shù)，期望將之推廣于臨床研究。
王菲，醫(yī)學(xué)博士，耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院精神科助理教授。主要研究興趣為多模態(tài)影像學(xué)在重性精神疾病中的應(yīng)用。在精神醫(yī)學(xué)，神經(jīng)科學(xué)以及影像醫(yī)學(xué)雜志（American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry, Brain等）發(fā)表SCI論文近50篇。先后獲得NIMH職業(yè)發(fā)展獎(jiǎng) K01, 兩次NARSAD青年研究員獎(jiǎng), Klingenstein Fundation 青年研究員獎(jiǎng)。為20多個(gè)國(guó)際雜志審稿，并參加中國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金委、美國(guó)National Institute of Healthy、以及英國(guó)Medical Research Council等基金的評(píng)審。
左西年，博士（應(yīng)用數(shù)學(xué)），中國(guó)科學(xué)院心理研究所研究員，博士生導(dǎo)師，中科院“百人計(jì)劃”入選者，國(guó)際“千人功能連接組計(jì)劃”方法學(xué)支撐，國(guó)際“神經(jīng)影像數(shù)據(jù)聯(lián)盟”咨詢團(tuán)成員。主要研究領(lǐng)域?yàn)槿四X功能連接組學(xué)及其應(yīng)用，主要研究方向：1）靜息態(tài)功能磁共振計(jì)算方法及其重測(cè)信度，2）人腦功能連接組發(fā)展軌線。最近五年在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表學(xué)術(shù)論文50篇，其中13篇為第一和/或通訊作者，13篇發(fā)表在神經(jīng)影像方法學(xué)領(lǐng)域國(guó)際最高水平的雜志NeuroImage上，被引1178次（他引1076次），年均引用236次，H指數(shù)18。第16屆國(guó)際人腦成像年會(huì)做大會(huì)口頭報(bào)告（2010），獲NeuroImage解剖與生理編輯選擇獎(jiǎng)（2010），受邀在劍橋大學(xué)“網(wǎng)絡(luò)與連接組論壇”做1小時(shí)報(bào)告（2012）。現(xiàn)任國(guó)際期刊《公共科學(xué)圖書(shū)館-綜合》（PLoS ONE）學(xué)術(shù)編委和統(tǒng)計(jì)編委、《腦成像方法前沿》（Frontiers in Brain Imaging Methods）評(píng)審編委；NeuroImage, Human Brain Mapping, Journal of Neuroscience, Archives of General (JAMA) Psychiatry, American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry，Neuroscience & Biobehavorial Reviews等30余個(gè)專業(yè)期刊審稿人；荷蘭Marie Curie國(guó)際基金、A-star新加坡國(guó)立大學(xué)-美國(guó)杜克大學(xué)聯(lián)合基金評(píng)審專家、英國(guó)醫(yī)學(xué)研究理事會(huì)（MRC）基金評(píng)審專家；目前主持國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、國(guó)際重大合作項(xiàng)目、中國(guó)科學(xué)院重點(diǎn)部署項(xiàng)目和中國(guó)科學(xué)院儀器設(shè)備功能開(kāi)發(fā)技術(shù)創(chuàng)新項(xiàng)目各一項(xiàng)。詳細(xì)信息請(qǐng)參見(jiàn)課題組網(wǎng)站：
http://lfcd.psych.ac.cn/index.html 和http://scholar.google.com/citations?user=a3-gVGMAAAAJ&hl=en
龔高浪，國(guó)家自然科學(xué)優(yōu)秀青年基金獲得者，北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員，博士生導(dǎo)師。2006年畢業(yè)于中科院自動(dòng)化所，獲博士學(xué)位，2006-2010赴加拿大Alberta大學(xué)、Mcgill大學(xué)從事博士后研究，2011年至今在北師大認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作。榮獲scopus“青年科學(xué)之星”（生命領(lǐng)域），入選北京市科技新星計(jì)劃。主要從事基于結(jié)構(gòu)與彌散磁共振神經(jīng)影像的活體腦連接與腦網(wǎng)絡(luò)研究，已在本領(lǐng)域權(quán)威期刊（如Journal of neuroscience, cerebral cortex, neuroimage等 ）發(fā)表SCI論文多篇，相關(guān)研究工作得到了國(guó)內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注和高度評(píng)價(jià)，發(fā)表論文已被SCI引用超過(guò)700次。獲批軟件著作權(quán)3項(xiàng)（如PANDA軟件），發(fā)明專利1項(xiàng)。 現(xiàn)任PLoS ONE學(xué)術(shù)編輯(academic editor)，國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、中荷聯(lián)合科研主題（JSTP）項(xiàng)目評(píng)審專家，并擔(dān)任多個(gè)國(guó)際期刊審稿人，現(xiàn)承擔(dān)多項(xiàng)國(guó)家級(jí)科研項(xiàng)目（如國(guó)自然面上項(xiàng)目、科技部973（青年科學(xué)家項(xiàng)目）科研骨干、國(guó)家社科基金重大專項(xiàng)子課題負(fù)責(zé)人等）。
夏明睿，博士，北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科研助理。主要研究方向?yàn)殪o息態(tài)腦功能網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算方法，及其在神經(jīng)精神疾病中的應(yīng)用，腦網(wǎng)絡(luò)可視化等。在國(guó)際期刊發(fā)表SCI論文數(shù)篇，編寫(xiě)了腦網(wǎng)絡(luò)繪制軟件BrainNet Viewer，下載量達(dá)5000余次，用該軟件繪制圖片的期刊封面文章5篇。曾獲認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室優(yōu)秀學(xué)術(shù)成果獎(jiǎng)、教育部博士研究生學(xué)術(shù)新人獎(jiǎng)等。
3. 課程安排
2013年11月21日（晚上7:00開(kāi)始）：warmup course
-
Step-by-step processing and analysis of R-fMRI data (Mingrui Xia&Xinian Zuo)
2013年11月22日（上午8:30開(kāi)始）：
-
R-fMRI: biophysical mechanisms of BOLD imaging (Anthony Liu)
-
R-fMRI: introduction of resting-state BOLD fMRI (Yufeng Zang)
-
Multi-modal integration: R-fMRI and perfusion MRI (Anthony Liu)
-
R-fMRI: pre-processing steps and relevant considerations (Xinian Zuo)
-
R-fMRI: local activity --method and applications to brain disorders and memory consolidation (Yufeng Zang)
-
R-fMRI: seed-based connectivity analysis--methods and applications (Mingrui Xia)
-
Panel discussion: R-fMRI technique—experimental design and data analysis
2013年11月23日：(8：30)
-
R-fMRI: ICA-based connectivity analysis --methods and applications (Xinian Zuo)
-
R-fMRI: graph-based network analysis--methods and applications (Yong He)
-
R-fMRI: studying cognition (Yanchao Bi)
-
R-fMRI: studying neuropsychiatric disorders (Fei Wang)
-
Panel discussion: R-fMRI connectivity analysis and applications
-
Student： Oral presentation
2013年11月24日（下午4：00結(jié)束）：
-
Multi-modal integration: R-fMRI and diffusion MRI (Gaolang Gong)
-
R-fMRI packages: analysis and visualization tools (Mingrui Xia)
-
How to write R-fMRI papers (Yong He)
以上報(bào)告均以中文授課
4. 備注
¨ 培訓(xùn)費(fèi)：每人3000元（提供“培訓(xùn)費(fèi)”正式發(fā)票），包括培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、餐費(fèi)； 交通及住宿費(fèi)用自理。
¨ 培訓(xùn)地點(diǎn)：北京市圓山大酒店（北京市西城區(qū)裕民路2號(hào)）。
¨ 學(xué)員住宿地點(diǎn)：北京市圓山大酒店 標(biāo)準(zhǔn)雙人間：300元/間/天（150元/人/天）
¨ 全體學(xué)員于2013年11月21日下午在北京市圓山大酒店大堂集中報(bào)到，21日晚
上19:00開(kāi)始上課，22-24日全天培訓(xùn)，課程于24日下午4時(shí)結(jié)束。
¨ 最終課程安排以報(bào)到當(dāng)日發(fā)放的課程表為準(zhǔn)。
¨ 報(bào)名方法：電話或電子郵件均可，最好以電話確認(rèn)。
¨ 培訓(xùn)班限額招生，為便于會(huì)務(wù)安排，報(bào)名敬請(qǐng)從速。
¨ 報(bào)名截至日期：2013年11月10日
為便于會(huì)務(wù)安排，報(bào)名敬請(qǐng)從速！
北京報(bào)名點(diǎn)：
交費(fèi)方法：會(huì)議前銀行轉(zhuǎn)賬或現(xiàn)場(chǎng)交現(xiàn)金（現(xiàn)場(chǎng)不能刷卡）
如通過(guò)銀行匯款，請(qǐng)將學(xué)費(fèi)匯至下列賬號(hào)（注明：2013北京fMRI培訓(xùn)班）：
戶 名：北京中科美德醫(yī)療信息科技有限公司
開(kāi)戶行：中國(guó)建設(shè)銀行北京阜成路支行
賬 號(hào)：11001085400059610940
北京市圓山大酒店路線圖：
地址：北京市西城區(qū)裕民路2號(hào)
酒店聯(lián)系電話： 010-62023328，62010033
神經(jīng)影像分析軟件培訓(xùn)計(jì)劃survey
常用軟件及功能列表
|
功能 領(lǐng)域
|
子領(lǐng)域
|
軟件名稱
|
功能簡(jiǎn)述
|
興趣 指數(shù)*
|
|
DTI
|
|
DTI studio
|
DTI Studio是一個(gè)在Windows下運(yùn)行的擴(kuò)散張量圖像后處理程序。適合張量計(jì)算，顏色映射，白質(zhì)纖維束跟蹤，三維可視化等任務(wù)。
|
|
|
MedInria
|
MedINRIA是由法國(guó)INRIA開(kāi)發(fā)的醫(yī)學(xué)影像后處理平臺(tái)。包含醫(yī)學(xué)影像可視化，DTI纖維束跟蹤與張量顯示，圖像配準(zhǔn)，多硬化癥分析，腦溝回可視化等功能。
|
|
|
FSL
|
FSL偏重于DTI的統(tǒng)計(jì)學(xué)處理分析。
|
|
|
TBSS
|
TBSS是FSL軟件下的一個(gè)DTI數(shù)據(jù)處理工具，主要用于比較不同組人群之間局部FA或其他DTI參數(shù)的差異，與VBM或VBA比較相近，但所使用的算法完全不同，是目前DTI數(shù)據(jù)中比較常用的軟件之一。
|
|
|
TrackVis
|
TrackVis是一款多平臺(tái)DTI數(shù)據(jù)處理軟件，可以在Windows系統(tǒng)或Linux系統(tǒng)下使用，可用于計(jì)算計(jì)算纖維束走形和顯示非常方便的軟件。該軟件由兩個(gè)工具箱構(gòu)成，Diffusion Toolkit用于計(jì)算DTI或HARDI數(shù)據(jù)以及常用的各參數(shù)，如ADC、FA、本征值等。TrackVis用于對(duì)計(jì)算出的神經(jīng)纖維束顯示和分析，可以手工畫(huà)ROI或VOI也可以通過(guò)導(dǎo)入ROI或VOI進(jìn)行纖維束追蹤，并可分析通過(guò)ROI的纖維束數(shù)目及長(zhǎng)度等信息。是目前比較好用的一款DTI數(shù)據(jù)處理軟件，上手比較容易。
|
|
|
腦結(jié)構(gòu)連接分析
|
PANDA
|
PANDA是基于FSL等軟件開(kāi)發(fā)的dMRI數(shù)據(jù)處理軟件。它可以全自動(dòng)地對(duì)大量的被試進(jìn)行預(yù)處理，并產(chǎn)生用于voxel-based、atlas-based和TBSS-based統(tǒng)計(jì)分析所需的數(shù)據(jù)；此外可以通過(guò)確定性追蹤和概率追蹤進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。軟件可以同時(shí)并行分析大批量的數(shù)據(jù)。(www.nitrc.org/projects/panda/)
|
|
|
fMRI
|
靜息態(tài)fMRI
|
REST
|
REST是一個(gè)靜息態(tài)功能磁共振數(shù)據(jù)分析工具，可以計(jì)算功能連接（FC），區(qū)域同質(zhì)性（ReHo值），振幅低頻率波動(dòng)（ALFF），Granger因果分析（GCA）等指標(biāo)。同時(shí)包含豐富的圖像分析工具，如各種統(tǒng)計(jì)分析、可視化，多重比較校正，時(shí)間序列提取，結(jié)果出圖等。
|
|
|
FSL - MELODIC
|
FSL MELODIC 3.0是牛津大學(xué)開(kāi)發(fā)的一個(gè)功能磁共振后處理軟件。該方法無(wú)需指定任何先驗(yàn)?zāi)Ｐ停瑧{借獨(dú)立分量分析(ICA)將單個(gè)或多個(gè)四維數(shù)據(jù)集分解成不同的空間和時(shí)間組件，從而尋找活躍區(qū)域。
|
|
|
GIFT
|
基于Matlab的專門(mén)用來(lái)做ICA分析的工具包，可以用來(lái)進(jìn)行基于任務(wù)fMRI和靜息fMRI的ICA分析及其后續(xù)分析。
|
|
|
MICA
|
基于Matlab的易于操作的ICA分析軟件。可以實(shí)現(xiàn)較大樣本量數(shù)據(jù)的ICA分析，通過(guò)多次運(yùn)算求得穩(wěn)定的ICA分析結(jié)果，克服ICA分析的不穩(wěn)定性。
|
|
|
DPARSF(A)
|
流水線式自動(dòng)化的fMRI和靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)預(yù)處理，靜息態(tài)fMRI數(shù)據(jù)后處理工具包。可以實(shí)現(xiàn)目前主流的各種靜息態(tài)fMRI指標(biāo)的計(jì)算。可以實(shí)現(xiàn)并行的快速計(jì)算。
|
|
|
任務(wù)態(tài)fMRI
|
SPM
|
SPM是分析功能成像數(shù)據(jù)教主流的一個(gè)軟件包。可以分析多種腦成像數(shù)據(jù)，包括fMRI，PET，SPECT，EEG和MEG。
|
|
|
GLM Flex
|
基于Matlab和SPM的二次統(tǒng)計(jì)（組分析）分析軟件，除了SPM包括的那些簡(jiǎn)單模型（單樣本，雙樣本t檢驗(yàn)等），還允許更多功能如mixed ANOVA，2×2被試內(nèi)設(shè)計(jì)，多于兩因素的ANOVA分析。
|
|
|
FSL-FEAT
|
FSL FEAT基于模型的fMRI數(shù)據(jù)分析軟件， FEAT對(duì)于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和分析具有很高的靈活性，適合于復(fù)雜的功能磁共振實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)任務(wù)。
|
|
|
AFNI
|
AFNI是在linux上運(yùn)行的分析功能成像數(shù)據(jù)的工具集。可以分析多種腦成像數(shù)據(jù)，包括fMRI，PET，SPECT等。
|
|
|
|
LISREL
|
LISREL (Linear Structural Relations)是由K.G. Joreskog & D. Sorbom所發(fā)展的結(jié)構(gòu)方程模型 (Structural Equation Modeling)軟件. LISREL被認(rèn)為是最專業(yè)的結(jié)構(gòu)方程模塊（Structural Equation Modeling, 簡(jiǎn)稱 SEM ）分析工具,通過(guò)fMRI數(shù)據(jù)可以對(duì)大腦進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建（帶有方向性），并對(duì)所做模型供驗(yàn)證性因素分析。由于LISREL在探討多變項(xiàng)因果關(guān)系上的強(qiáng)力優(yōu)勢(shì)，最早LISREL運(yùn)用于社會(huì)學(xué)研究,最近隨著腦科學(xué)研究的進(jìn)展也有不少研究人員將結(jié)構(gòu)方程模型運(yùn)用于大腦網(wǎng)絡(luò)的研究進(jìn)而探討多變項(xiàng)或單變項(xiàng)之間的因果關(guān)系。
|
|
|
Structural MRI
|
皮層
|
Freesurfer
|
FreeSurfer是哈佛大學(xué)開(kāi)發(fā)的磁共振神經(jīng)影像分析，主要用于測(cè)量大腦皮層的厚度和統(tǒng)計(jì)分析。
|
|
|
溝回
|
BrainVISA
|
BrainVISA 可以用來(lái)分析T1加權(quán)大腦MR圖像，包括灰/白質(zhì)分類，左右半球表面的提取與可視化，大腦皮質(zhì)溝回的提取、標(biāo)記等。
|
|
|
結(jié)構(gòu)
|
SPM
|
測(cè)腦體積、VBM、及其他
|
|
|
多模態(tài)磁共振數(shù)據(jù)分析
|
腦網(wǎng)絡(luò)分析
|
GRETNA
|
GRETNA是一個(gè)針對(duì)磁共振影像數(shù)據(jù)開(kāi)發(fā)的基于圖論的復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)分析軟件。該軟件可以對(duì)腦功能影像進(jìn)行自動(dòng)預(yù)處理，并能批量計(jì)算常用的二值化或者加權(quán)腦網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)鋵傩裕珙惥巯禂?shù)、最短路徑長(zhǎng)度、小世界屬性、網(wǎng)絡(luò)效率、模塊化、節(jié)點(diǎn)度、節(jié)點(diǎn)介數(shù)、節(jié)點(diǎn)效率等，并能對(duì)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析(www.nitrc.org/projects/gretna)
|
|
|
腦網(wǎng)絡(luò)可視化
|
BrainNet Viewer
|
BrainNet Viewer是一個(gè)腦網(wǎng)絡(luò)可視化軟件，提供了豐富的設(shè)置來(lái)幫助研究者快速、靈活、方便地展示腦連接網(wǎng)絡(luò)的信息。該軟件支持顯示基于圖論的三維腦網(wǎng)絡(luò)模型以及體數(shù)據(jù)到三維腦曲面的映射，并能夠?qū)@示結(jié)果保存成常用的圖片格式或制作展示電影動(dòng)畫(huà)(www.nitrc.org/projects/bnv/)
|
|
|
多功能平臺(tái)
|
3D slicer
|
3D Slicer是一個(gè)開(kāi)放式的醫(yī)學(xué)影像后處理平臺(tái)，可以創(chuàng)建特定主題的醫(yī)學(xué)圖像分析和可視化工具。包含
多種模態(tài)成像如MRI，CT，超聲，核醫(yī)學(xué)等，可以分析從頭部到腳的多個(gè)器官影像，具有較好的可擴(kuò)展性。
|
|
|
|
FSL
|
測(cè)體積、VBM、及其他
|
|
*興趣指數(shù)：1-5: 1=最不想學(xué)，5=最想學(xué)
第九屆功能磁共振影像(fMRI)
---靜息態(tài)fMRI技術(shù)及應(yīng)用專題培訓(xùn)班（2013.11.21-24 中國(guó)?北京）
報(bào)名回執(zhí)表
? 2021 深圳市美德醫(yī)療電子技術(shù)有限公司 版權(quán)所有